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本指南将帮助你在 5 分钟内上手生物信息分析系统。

环境要求

要求 最低配置 推荐配置
Python 3.10+ 3.11+
内存 8GB 16GB+
磁盘 50GB 100GB+
GPU 可选 NVIDIA 8GB+

安装部署

1. 克隆项目

git clone https://github.com/your-org/bioinfo-system-new.git
cd bioinfo-system-new

2. 创建虚拟环境

python -m venv .venv
source .venv/bin/activate  # Linux/Mac
# 或 .venv\Scripts\activate  # Windows

3. 安装依赖

pip install -r requirements.txt

4. 配置环境变量

cp .env.example .env
# 编辑 .env 填入必要的配置

5. 启动服务

# 开发模式
python -m uvicorn main:app --reload --host 0.0.0.0 --port 8000

# 生产模式
python -m uvicorn main:app --host 0.0.0.0 --port 8000 --workers 4

6. 访问系统

打开浏览器访问: http://localhost:8000

登录账号

账号 密码 角色 权限
admin admin123 管理员 全部功能
user user123 普通用户 基础分析
demo demo 演示账号 只读

首次使用

1. 上传数据

支持的文件格式：

分析类型 支持格式
16S测序 .fastq.gz, .fq.gz, .fastq
体检报告 .pdf, .jpg, .png, .xlsx
基因检测 .vcf, .pdf, .csv

2. 创建分析任务

  1. 选择分析类型
  2. 上传数据文件
  3. 设置参数（可选）
  4. 提交分析

3. 查看结果

  • 在线查看分析报告
  • 下载 PDF 完整报告
  • 导出原始数据

常见问题

服务无法启动？

检查端口是否被占用：lsof -i :8000

上传文件失败？

检查文件大小是否超过 50MB

分析超时？

尝试减少数据量或等待服务器空闲

下一步

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